Electronic Theses and Dissertation

Identifikasi dan karakterisasi gen calpain (capn1) pada kambing kacang abstrak penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan dan karakteristik gen calpain untuk perbaikan mutu genetik pada kambing kacang (capra hircus). sampel penelitian yang digunakan adalah darah yang diambil dari 5 ekor kambing kacang yang dipelihara di upt hewan coba fkh unsyiah banda aceh. tahap pertama dilakukan isolasi dna dari darah, tahap kedua dilakukan elektroforesis, hasil ekstraksi kemudian dilanjutkan dengan optimasi suhu annealing, amplifikasi dan sekuensing. hasil sekuensing dianalisis menggunakan software program basic local alignment search tool (blast) dan clustal w dari program mega 6.01. hasil optimasi suhu annealing diperoleh suhu 56°c merupakan suhu yang tepat untuk melakukan amplifikasi. semua sampel yang diteliti amplifikasi gen calpain diperoleh hasil sepanjang 709 bp sesuai dengan primer yang digunakan. hasil analisis program blast dan program mega 6.01. menunjukkan kekerabatan yang sangat dekat, ditandai dengan berada pada satu cabang dari pohon filogenetik dan hasil urutan gen calpain (capn1) kambing kacang (capra hircus) memiliki kedekatan dengan gen calpain capra hircus breed barbari sebesar 98%. hasil penelitian ini dapat disimpulkan bahwa gen calpain pada kambing kacang yang teramplifikasi sepanjang 709 bp, dan mempunyai kedekatan sekuen nukleotida dengan gen calpain pada beberapa jenis kambing lainnya dan dapat digunakan untuk perbaikan mutu genetik kambing kacang.